Виртуальная организация SysBio

Цель виртуальной организации SysBio, созданной Лабораторией системной биологии ИМБГ НАНУ, - развитие параллельных вычислений в биологии и исследование регуляции генов у эукариотов. Основное направление исследований - реконструкция сетей генной регуляции с использованием ресурсов Украинского национального грида (УНГ).

Реконструкция сетей генной регуляции - это задача нахождения топологии корреляции и взаимодействия генных продуктов из высокопроизводительных биологических данных, преимущественно микромассивов, но и ChIP-chip и данных протеомики. В зависимости от используемого метода вычислительная сложность данной задачи может быть очень большой, поскольку пространство поиска оптимальной генной сети растет экспоненциально в то время, как количество генов растет линейно. Это обусловливает использование високопараллельних вычислений с помощью распределенных кластерных систем, таких как УНГ.

Использование ресурсов ВО SysBio является свободным и бесплатным для зарегистрированных членов при условии выполнения правил пользования. Все желающие присоединиться к исследованию генных сетей и разработки алгоритмов реконструкции могут обращаться к ответственным лицам.

Сайт: http://sysbio.org.ua

Контактное лицо организации: Алина Фролова - fshodan@gmail.com